奧塔哥大學(xué)有全新西蘭第一所醫(yī)學(xué)院，并且是南島的醫(yī)學(xué)研究中心，由于是第一個(gè)將試管嬰兒付諸實(shí)際的醫(yī)學(xué)中心，因此在世界上享有盛名。奧塔哥大學(xué)也有全新西蘭唯一的牙醫(yī)學(xué)校，其國(guó)際排名更是在前十名內(nèi)，且為大洋洲第一名。此外，本校也是南島唯一有藥學(xué)、理療、醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)等科系的學(xué)校。這所醫(yī)學(xué)院至今依舊聞名，其入學(xué)的要求與一般大學(xué)相同，只要在大學(xué)入學(xué)考試中考過(guò)三個(gè)科目便能就讀，因此每年吸引近千名學(xué)生來(lái)此地就讀，大家共修第一年科目，然后依成績(jī)決定往后的專(zhuān)業(yè)科系。醫(yī)學(xué)院每年錄取一百八十位學(xué)生，牙醫(yī)六十位，藥學(xué)約一百八十位。若未進(jìn)任何理想科目的學(xué)生，可轉(zhuǎn)修其他科系，可用二年級(jí)成績(jī)重新申請(qǐng)牙醫(yī)或者是讀完一個(gè)學(xué)位后，重新申請(qǐng)學(xué)士后醫(yī)學(xué)院。
　　其他非醫(yī)學(xué)科系，如生理，解剖等也是世界有名的，新興科系如生化，基因工程，或者是基礎(chǔ)科學(xué)如物理、化學(xué)、數(shù)學(xué)等也都有開(kāi)課，另外還有商學(xué)和法學(xué)等科目。尤其是商學(xué)院，和奧克蘭大學(xué)的商學(xué)院一樣，聞名于新西蘭，每年都有百多位國(guó)際留學(xué)生，來(lái)此地取得奧塔哥大學(xué)MBA的學(xué)位。