■ 學(xué)部(11個)
・文學(xué)部(人文學(xué)科)
・國際文化學(xué)部(國際文化學(xué)科)
・發(fā)達(dá)科學(xué)部(人類形成學(xué)科、人類行動學(xué)科、人類表現(xiàn)學(xué)科、人類環(huán)境學(xué)科)
・法學(xué)部(法律學(xué)科)
・經(jīng)濟(jì)學(xué)部(經(jīng)濟(jì)學(xué)科)
・經(jīng)營學(xué)部(經(jīng)營學(xué)科)
・理學(xué)部(數(shù)學(xué)科、物理學(xué)科、化學(xué)科、生物學(xué)科、地球行星科學(xué)科)
・醫(yī)學(xué)部(醫(yī)學(xué)科、保健學(xué)科)
・工學(xué)部(建筑學(xué)科、市民工學(xué)科、電氣電子工學(xué)科、機械工學(xué)科、應(yīng)用化學(xué)科、情報智能工學(xué)科)
・農(nóng)學(xué)部(食料環(huán)境系統(tǒng)學(xué)科、資源生命科學(xué)科、生命機能科學(xué)科)
・海洋科學(xué)部(海洋技術(shù)經(jīng)營管理學(xué)科、海洋物流科學(xué)科、海洋工學(xué)技術(shù)學(xué)科)
■ 大學(xué)院(14個)
・人文學(xué)研究科(文化構(gòu)造、社會動態(tài))
・國際文化學(xué)研究科(文化相關(guān)、全球文化)
・人類發(fā)達(dá)環(huán)境學(xué)研究科(人類發(fā)達(dá)、人類環(huán)境學(xué))
・法學(xué)研究科(理論法學(xué)、政治學(xué)、實務(wù)法律)
・經(jīng)濟(jì)學(xué)研究科(經(jīng)濟(jì)學(xué))
・經(jīng)營學(xué)研究科(經(jīng)營學(xué)、現(xiàn)代經(jīng)營學(xué))
・理學(xué)研究科(數(shù)學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)、地球惑星科學(xué))
・醫(yī)學(xué)研究科(生物醫(yī)學(xué)、醫(yī)科學(xué))
・保健學(xué)研究科(保健學(xué)專攻)
・工學(xué)研究科(建筑學(xué)、市民工學(xué)、電氣電子工學(xué)、機械工學(xué)、應(yīng)用化學(xué))
・系統(tǒng)情報學(xué)研究科(系統(tǒng)科學(xué)、情報科學(xué)、計算科學(xué))
・農(nóng)學(xué)研究科(食料共生系統(tǒng)學(xué)、資源生命科學(xué)、生命機能科學(xué))
・海事科學(xué)研究科(海事科學(xué))
・國際協(xié)力研究科(國際開發(fā)政策、國際協(xié)力政策、地域協(xié)力政策)
2010年,日本在神戶人工島設(shè)置了世界最先進(jìn)的超級計算機,神戶大學(xué)借此機會將工學(xué)研究科的系統(tǒng)情報的相關(guān)學(xué)科獨立出來,成立了系統(tǒng)情報學(xué)研究科,并設(shè)置了系統(tǒng)科學(xué)、情報科學(xué)、計算科學(xué)三個專業(yè)。