■ 學部(11個)
・文學部(人文學科)
・國際文化學部(國際文化學科)
・發(fā)達科學部(人類形成學科、人類行動學科、人類表現(xiàn)學科、人類環(huán)境學科)
・法學部(法律學科)
・經(jīng)濟學部(經(jīng)濟學科)
・經(jīng)營學部(經(jīng)營學科)
・理學部(數(shù)學科、物理學科、化學科、生物學科、地球行星科學科)
・醫(yī)學部(醫(yī)學科、保健學科)
・工學部(建筑學科、市民工學科、電氣電子工學科、機械工學科、應用化學科、情報智能工學科)
・農(nóng)學部(食料環(huán)境系統(tǒng)學科、資源生命科學科、生命機能科學科)
・海洋科學部(海洋技術經(jīng)營管理學科、海洋物流科學科、海洋工學技術學科)
■ 大學院(14個)
・人文學研究科(文化構造、社會動態(tài))
・國際文化學研究科(文化相關、全球文化)
・人類發(fā)達環(huán)境學研究科(人類發(fā)達、人類環(huán)境學)
・法學研究科(理論法學、政治學、實務法律)
・經(jīng)濟學研究科(經(jīng)濟學)
・經(jīng)營學研究科(經(jīng)營學、現(xiàn)代經(jīng)營學)
・理學研究科(數(shù)學、物理學、化學、生物學、地球惑星科學)
・醫(yī)學研究科(生物醫(yī)學、醫(yī)科學)
・保健學研究科(保健學專攻)
・工學研究科(建筑學、市民工學、電氣電子工學、機械工學、應用化學)
・系統(tǒng)情報學研究科(系統(tǒng)科學、情報科學、計算科學)
・農(nóng)學研究科(食料共生系統(tǒng)學、資源生命科學、生命機能科學)
・海事科學研究科(海事科學)
・國際協(xié)力研究科(國際開發(fā)政策、國際協(xié)力政策、地域協(xié)力政策)
2010年,日本在神戶人工島設置了世界最先進的超級計算機,神戶大學借此機會將工學研究科的系統(tǒng)情報的相關學科獨立出來,成立了系統(tǒng)情報學研究科,并設置了系統(tǒng)科學、情報科學、計算科學三個專業(yè)。