長崎大學把教育和研究兩方面爭創(chuàng)世界一流作為目標，推進戰(zhàn)略性教育研究計劃，謀求教育與研究的進一步高度化與個性化。在「學生顧客主義」的標語下，充實基礎教育、學部專業(yè)教育、大學院教育以提供最高水平的教育,同時在入學選拔、課外活動、就職等涉及學生生活的各方面進一步強化支援體制。 進行知識產(chǎn)權的適當管理，通過靈活運作知識產(chǎn)權與人、物資源的地域聯(lián)合、產(chǎn)學官聯(lián)合、國際性聯(lián)合，推進教育與研究成果回歸社會。
1923年成為長崎醫(yī)科大學的同時，縣立長崎醫(yī)院被國家托付給長崎醫(yī)科大學而成為了它的附屬醫(yī)院。另外，與醫(yī)科大學同時設立的還有附屬醫(yī)學專門部以及附屬藥學專門部，此外，還開設了附屬醫(yī)院婦產(chǎn)護士培訓所。
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