學部

　　教育學部

　　経済學部

　　醫(yī)學部

　　歯學部

　　薬學部

　　工學部

　　環(huán)境科學部

　　水產(chǎn)學部

　　醫(yī)療技術短期大學部(因為改組為四年制醫(yī)學部保健學科，2002年度以后停止招生）

　　大學院

　　教育學研究科

　　教職實踐專業(yè)（專業(yè)學位課程，教職大學院）

　　教科實踐專業(yè)（修士課程）

　　經(jīng)濟學研究科（博士前期課程·博士后期課程）

　　工學研究科（2011年（平成23年）度比生產(chǎn)科學研究科從改組）

　　綜合工學專業(yè)（博士前期課程）

　　生產(chǎn)系統(tǒng)工程專業(yè)（博士后期課程）

　　綠色系統(tǒng)創(chuàng)建科學專業(yè)（5年一貫博士課程）

　　水產(chǎn)·環(huán)境科學綜合研究科（2011年（平成23年）度比生產(chǎn)科學研究科從改組）

　　水產(chǎn)學專業(yè)（博士前期課程）

　　環(huán)境保全設計專業(yè)（博士前期課程）

　　環(huán)境共生政策學專攻（博士前期課程）

　　海洋環(huán)境資源學專攻（博士后期課程）

　　海洋場生命科學專業(yè)（5年一貫博士課程）

　　醫(yī)齒藥學綜合研究科

　　修士課程

　　熱帶醫(yī)學專業(yè)

　　保健學專業(yè)

　　生命科學專業(yè)藥

　　博士課程

　　醫(yī)療科學專攻

　　新興感染癥病情控制學系專業(yè)

　　放射線醫(yī)學科學專攻

　　博士后期課程

　　生命科學專業(yè)藥

　　國際健康開發(fā)研究科（修士課程）

　　國際健康開發(fā)專業(yè)

　　附直研究所

　　長崎大學熱帶醫(yī)學研究所（坂本，通稱：熱研）