截止2007年，大學(xué)主體由7個系，1個學(xué)院和1個研究所組成：

　　科學(xué)系（lafacultédessciences）

　　醫(yī)學(xué)系（lafacultédemédecine）

　　文學(xué)系（lafacultédeslettres）

　　經(jīng)濟與社會科學(xué)系（lafacultédesscienceséconomiquesetsociales）

　　法學(xué)系（lafacultédedroit）

　　神學(xué)系（lafacultédethéologie）

　　心理學(xué)和教育學(xué)系（lafacultédepsychologieetdessciencesdel'éducation）

　　翻譯學(xué)院（Écoledetraductionetd'interprétation）

　　建筑學(xué)研究所（Institutd'architecture）

　　大學(xué)的從屬學(xué)院還包括八個系屬學(xué)校和跨系別研究中心：

　　法語文化及語言學(xué)校（Écoledelangueetdecivilisationfrançaises）（文學(xué)系下屬）

　　體育教育學(xué)校（Écoled'éducationphysiqueetdesport）（醫(yī)學(xué)系下屬）

　　大學(xué)信息中心（Centreuniversitaireinformatique）

　　大學(xué)人口生態(tài)學(xué)及環(huán)境科學(xué)中心（Centreuniversitaired'écologiehumaineetdessciencesdel'environnement）

　　大學(xué)能源問題研究中心（Centreuniversitaired'étudedesproblèmesdel'énergie）

　　老年問題中心（Centreinterfacultairedegérontologie）

　　宗教改革史研究所（Institutd'histoiredelaréformation）

　　日內(nèi)瓦大學(xué)歐洲中心（Instituteuropéendel'universitédeGenève）

　　以下獨立學(xué)院也依托于日內(nèi)瓦大學(xué)：

　　高級國際關(guān)系及發(fā)展學(xué)院（Institutdehautesétudesinternationalesetdudéveloppement），2008年由原國際高等教育學(xué)院（Institutdehautesétudesinternationales）和國際發(fā)展學(xué)院（Institutuniversitaired’étudesdudéveloppement）合并而成

　　Bossey神學(xué)院（Institut?cuméniquedeBossey）